Мусин-Пушкин принадлежал к малому числу представителей аристократии XVIII века, посвятивших себя науке. Отец его (которого он, впрочем, рано лишился) возглавлял Берг-коллегию (ведомство горного дела), чем, может быть, и объясняется его увлечение естественными науками.
Мусин-Пушкин выбрал служебное поприще под стать научным склонностям — занимал должность вице-президента Горной коллегии. В 1802 году изъявил желание «пожертвовать приятной жизнью пользам любезного отечества» и продолжить начатое его отцом дело изыскания руд богатых металлов. Отправился во вновь присоединённую Грузию для минералогических и ботанических исследований в качестве главноначальствующего над горными производствами на Кавказе.
Князь Иван Долгорукий в своём «Капище» посвятил нечто вроде эпитафии покойному, с которым в молодости он был «хорошо знаком: вместе разыгрывали разные роли, живали в одном месте, одним кумирам поклонялись». По словам Долгорукого, это был «человек придворный», который «нашёл конец свой там, где ожидал учёной славы»:
- Н. М. Раскин. Аполлос Аполлосович Мусин-Пушкин: вице-президент Берг-коллегии, химик и минералог, 1760-1805. «Наука», Ленинградское отделение, 1981. Стр. 117.